有明海は、広大な干潟と独特の生態系を有する生産性の豊かな海ですが、近年は流れの変化、底質の悪化（細粒化）、赤潮の多発、貧酸素水塊（海中に酸素が少ない状態）の発生など、海の環境が悪化しています。
その結果、有明海特有のタイラギ、サルボウ、アゲマキやアサリ等の二枚貝類の漁獲量が大幅に減少するという非常に深刻な状況が続いています。
かつての豊かな海・有明海を取り戻すために、佐賀県では
- 有明海への汚濁物質の負荷を減らし水産資源を回復させるための計画（「有明海再生に関する佐賀県計画」）を作り、様々な事業を実施するとともに、県民協働による再生への取組を進めること
- NPO法人有明海再生機構や佐賀大学などとともに、有明海の環境変化の仕組みを科学的に解明すること
- とりわけ、諫早湾干拓事業潮受堤防排水門の開門調査－農業・防災・漁業が並立できる形での開門調査を実現すること
に全力で取組んでいます。
1 有明海の環境保全及び改善並びに漁業振興
2 有明海の環境変化の原因究明
